Novohradské hory v sobě ukrývají i dva vzácné pralesy - prales Hojná voda a Žofínský. Prales Hojná má celkovou plochu chráněného pralesovitého území 9,09 ha. Nalezneme zde především buk lesní, smrk ztepilý a ojediněle také břízu bělokorou. Na většině plochy chybí keřový podrost. Přímo do chráněné části pralesa není vstup povolen, nově je však zpřístupněna naučná stezka. Naučná stezka v okolí druhé nejstarší rezervace u nás vede po velmi dobře schůdných cestách, avšak se značným převýšením, které činí 130 m. Návštěvníci se seznámí s lesem, jeho faunou i flórou, stářím, vlivem člověka, výzkumem, mapováním, historií pralesa a významnými lesnickými exkurzemi.
Přírodní rezervace Žofínský prales je jednou z nejstarších rezervací v pevninské Evropě. Založil ji roku 1838 hrabě Jiří František August Buquoy na ploše 38,3 ha. Po téměř 100 letech, v roce 1933, vyhlásilo tehdejší ministerstvo školství a národní osvěty Žofínský prales úplnou státní rezervací s výměrou 97,72 ha. Dnešní 102,71h rozlehlá přírodní rezervace skrývá chráněný porost květnatých bučin a podmáčených smrčin, kde se také objevuje kyčelnice devítilistá, kostival lékařský nebo violka lesní. V současné době není prales veřejnosti přístupný, ale ze silnice na severní straně můžeme alespoň nahlédnout, jaké krásy prales skrývá.